هر كدام از گروه‏هاى مذكور در درون خود داراى گرايش‏هاى تخصصى بوده كه بررسى، نقد و ارزيابى متون را با توجه به گرايش‏هاى مذكور پيگيرى مى‏نمايند. بعنوان مثال: گروه         علوم سياسى داراى گرايش‏هاى تخصصى: انديشه‏هاى سياسى، مطالعات ايران، مطالعات سياسى - اسلامى، جامعه‏شناسى سياسى و سياست تطبيقى، روابط بين‏الملل             و سازمان‏هاى بين‏المللى و مطالعات منطقه‏اى مى‏باشد.گروه‏هاى تخصصى شورا به تناسب گرايش‏هاى مربوطه در درون گروه، داراى چند عضو رسمى مى‏باشند. حداقل اعضاء    هرگروه پنج نفر و افزايش تعداد اعضاء به پيشنهاد گروه و تصويب شورا بلامانع است. اعضاى رسمى گروه‏هاى تخصصى بر اساس اساسنامه بايد داراى شرايط زير باشند:

1- استاد دانشگاه يا حوزه بر حسب سنخيت و شأنيت دروس رشته‏ها

2- محقق و مؤلف متون و كتب علوم انسانى

3- مترجم متون درسى رشته‏هاى مربوطه.

 علاوه بر اعضاى رسمى، هر گروه تخصصى با سطح نامحدودى از اساتيد و صاحبنظران رشته مربوطه در ارتباط بوده و اساتيد مذكور از نظر سازمانى داوران گروه مى‏باشند.        گروه‏هاى تخصصى وظايف شناسايى، مطالعه، بررسى نقد و ارزيابى نهايى متون را بعهده داشته و با ارائه پيشنهادات جهت رفع اشكالات موجود در متون و يا چاپ آن در            فصلنامه تخصصى شورا و يا ساير نشريات علمى نقش ويژه‏اى را در بهبود كيفيت علمى متون ايفا مى‏كنند. گروه‏هاى تخصصى عموما ماهى يكبار جلسات رسمى خود را برگزار            و در صورت ضرورت مى‏توانند جلسات ويژه و همچنين جلسات مشتركى نيز با ساير گروه‏هاى ديگر داشته و متون مشترك رشته‏ها يا متون چند بعدى رشته‏هاى مختلف را مورد           نقد و بررسى قرار دهند. گروه‏هاى تخصصى در اولويت اول كليه كتاب‏ها، جزوات، مقالات و پايان‏نامه‏هاى دانشگاهى و مراكز پژوهشى مؤثر در رشته‏هاى مربوطه را در دستور كار         دارند و در كنار اين وظيفه مهم به ساير متونى كه توسط مؤلفين محترم و يا ناشرين غيردانشگاهى (اعم از ترجمه و تأليف) منتشر مى‏شود و اثرات قابل توجهى از جهت               علمى بر متوندانشگاهى دارد نيز خواهند پرداخت.از وظايف مهم گروه‏هاى تخصصى بررسى، ارزيابى و نقد متون دانشگاهى (اعم از اصلى و كمك درسى) بر اساس سرفصل‏هاى         مصوب است. همچنين تحولاتى كه در بسيارى از رشته‏ها و گرايش‏ها ضرورت دگرگونى سرفصل را ايجاب مى‏كند. نيز در دستور بررسى‏هاى گروه قرار دارد.

كليه متون موردنظر در گروه‏هاى تخصصى پس از شناسايى و تأييد گروه براى نقد و بررسى ابتدا توسط دو تن از اساتيد صاحب‏نظر، مورد ارزيابى و داورى قرار مى‏گيرد. ارزيابيها و      داوريها بر اساس آئين‏نامه اجرايى مبتنى بر نقاط قوت و ضعف شكلى، علمى، ارزشى و آموزشى مى‏باشد. هر متن داورى شده توسط دو تن از اساتيد گروه مورد بازبينى قرار      مى‏گيرد و در نهايت جمع‏بندى داورى‏ها و بازبينى‏ها در جلسات رسمى گروه مورد ارزيابى نهايى قرار گرفته و نظريه نهايى پيرامون متن مورد بررسى به اشكال زير منعكس شود:

 1- مكاتبه با مؤلف محترم

 2- مكاتبه با ناشر يا مركز سفارش دهنده

  3- نگارش نقدهاى مختصر و مفصل در فصلنامه شورا و يا ساير نشريات علمى معتبر.

چنانچه پاره‏اى از متون با دو داورى و دو ارزيابى به نتيجه نهايى نرسيد گروه‏ها اختيار كامل دارند كه به تعداد داوران و ارزيابان متن تا رسيدن به نتيجه نهايى اضافه نمايند.

شورا علاوه بر اساسنامه داراى آئين‏نامه اجرايى بررسى متون و كتب علوم انسانى بوده كه در آن حيطه كار شورا، حيطه كار گروه‏ها، شرايط عضويت، شرايط داورى، شيوه‏هاى    بررسى، بازبينى، ارزيابى و نهايى كردن متون، آئين كار شورا و گروه‏ها و قواعد و مقررات حاكم بر انتخاب، بررسى، بازبينى، ارزيابى و نقد علمى - آموزشى متون آورده شده است.

 در كنار سازمان علمى و اجرايى شورا، فصلنامه، نامه علوم انسانى قراردارد كه ارگان رسمى شورا بوده و بخش قابل توجهى از محصولات علمى و پژوهشى در قالب                 مقالات، نقدنامه‏هاى مختصر و مفصل و ويژه‏نامه‏هاى تخصصى به مجامع علمى و دانشگاهى عرضه مى‏شود.

امور اجرايى شورا توسط دبير و دبيرخانه پيگيرى مى‏شود. در كنار دبيرخانه، همه گروه‏هاى تخصصى داراى رئيس گروه (رابط گروه با شورا) و دبير گروه (رابط گروه با دبيرخانه شورا) مى‏باشند